El aeropuerto de Cuenca sólo está autorizado para operaciones locales. Diariamente, se realizan vuelos que unen esta ciudad andina, con Quito (la capital del país) y Guayaquil (el centro industrial y comercial del Ecuador).

La vía terrestre es, quizás, la forma más utilizada para llegar o salir de Cuenca. El terminal de autobuses -bastantes ordenado y limpio- se encuentra en la avenida España. Desde aquí podrá abordar las unidades que lo llevarán a Quito (cerca de 10 horas de viajes) y Guayaquil (5 horas). Las carreteras, en ambos casos, se encuentran en un estado aceptable. "En el trayecto de Cuenca a Quito -por vía terrestre- hace bastante frío, por lo que se recomienda llevar ropa de abrigo".